Durante la digestión, la acción química de las enzimas de los jugos digestivos (saliva, jugos gástricos, pancreáticos e intestinales) permite la fragmentación de las macromoléculas que componen los alimentos en moléculas simples, los nutrientes.

La simplificación molecular de los diferentes tipos de alimentos (carbohidratos, proteínas, lípidos) se produce a través del tubo digestivo:

• carbohidratos como el almidón (largas cadenas de moléculas de glucosa) son descompuestos en azúcares simples (glucosa) o azúcares dobles (maltosa) por las enzimas de la saliva en la boca, seguida de las enzimas pancreáticas (a nivel del duodeno) y por último, en el intestino delgado por las enzimas intestinales.
• las proteínas (largas cadenas de aminoácidos) se cortan en pequeños péptidos y aminoácidos libres por las enzimas gástricas (en el estómago), y luego por las enzimas pancreáticas, y, finalmente, por las enzimas intestinales.
• los lípidos, como los triglicéridos, se dividen en ácidos grasos libres y glicerol libre por las enzimas gástricas y las enzimas pancreáticas.